A longo prazo existe alto risco de desenvolvimento de distúrbios intestinais ou disfunção sexual com a radioterapia radical de próstata.

Durante o tratamento da radioterapia pode haver piora dos sintomas urinários, como aumento da frequência e da vontade de urinar.

Qualquer paciente com câncer de próstata localizado pode ser candidato à radioterapia radical, desde que possam realizar o tratamento por 6 a 9 semanas e estejam de acordo com os riscos e benefícios do tratamento.

A braquiterapia é o tratamento que oferece menor risco de impotência sexual, porém só está indicada em tumores de baixo risco e em alguns casos excepcionais de risco intermediário.

Assim como na cirurgia, há risco de não eliminação das células tumorais, levando a recidiva.