São finalidades do Sistema Nacional de Auditoria (SNA):

a) determinar as não conformidades dos serviços prestados e apontar os responsáveis.

b) avaliar as atividades, identificar as ações inadequadas e capacitar os profissionais para o desenvolvimento de melhores práticas.

c) analisar os gastos e fazer um estudo de viabilidade financeira do atendimento das especialidades contratadas.

d) aferir os indicadores e padrões estabelecidos e proceder ao levantamento de dados que permitam conhecer a qualidade, a quantidade, os custos e os gastos da atenção à saúde.

e) avaliar a qualidade e a efetividade dos serviços prestados à comunidade, considerando a relação entre a satisfação dos usuários e o menor gasto de materiais utilizados.