Os micróbios que vivem em condições extremas de temperatura, acidez e alcalinidade, ou salinidade são denominados extremófilos.

Quando um organismo morre, o processo de decomposição microbiana resulta na quebra hidrolítica de aminoácidos em proteínas.

Os microrganismos sobrevivem em um ambiente intensamente competitivo e devem explorar todas as vantagens que puderem. Alguns, como a bactéria do ácido láctico, que é tão útil na produção de laticínios, são capazes de fazer um nicho inóspito para organismos competidores.

A simbiose é a interação entre organismos e populações que coexistem, e o parasitismo é um tipo de simbiose no qual um micróbio extrai seus nutrientes e capacidades reprodutivas de outro organismo.

Os arbúsculos, pequenas estruturas em forma de arbusto, são formados dentro das células das plantas. Os nutrientes viajam do solo através das hifas fúngicas para esses arbúsculos, que gradualmente se rompem e liberam os nutrientes para as plantas.