Faltam dados meteorológicos em vários lugares do planeta e esses são fundamentais para alimentar as equações prognósticas.

As equações usadas para explicar as variações dinâmicas são aproximações dos processos atmosféricos.

As interações entre os componentes do sistema climático não estão completamente resolvidos, precisando muitas vezes que sejam parametrizados.

As equações que regem o comportamento da atmosfera possuem termos não-lineares sendo, portanto, muito dependentes do estado inicial como nos sistemas caóticos.

A atmosfera está sempre mudando.