O sistema de controle interno é inerente a todos os atos e processos administrativos de quaisquer órgão e entidade, devendo ser concebido sob a ótica da integração.

O sistema de controle interno, típico dos poderes executivos, se contrapõe aos controles externos dos demais poderes.

O controle interno, no âmbito do serviço público, corresponde à auditoria independente no setor privado, por atuar de forma esporádica e sob demanda.

As manifestações do controle interno são de caráter impositivo e punitivo, e independem de legislação específica.

O foco da atuação do controle interno está voltado para a despesa, havendo outros órgãos especializados voltados para o controle da receita.