A transmissão da febre amarela ocorre principalmente por meio da picada do vetor infectado, mas há pequena porcentagem de casos transmitidos de pessoa a pessoa.

Existem dois ciclos epidemiológicos de transmissão da doença, o silvestre e o urbano, cujas características etiológicas e clínicas são distintas.

No ciclo silvestre, macacos e roedores são os principais hospedeiros, e os vetores e amplificadores são mosquitos com hábitos preferencialmente silvestres.

No ciclo urbano, o ser humano é o único hospedeiro com importância epidemiológica, e o vetor é o mosquito Aedes aegypti.

A erradicação dos vetores é a principal ferramenta de prevenção da febre amarela.