Protocolo está relacionado ao armazenamento do documento, enquanto registro refere-se à sua recepção.

Protocolo refere-se ao processo de recebimento e controle de documentos, enquanto registro é o apontamento formal de cada entrada e saída.

Protocolo e registro são a mesma coisa e ambos representam o processo de autenticação dos documentos no fluxo de trâmite documental.

Protocolo refere-se ao processo de entrada do documento para armazenamento final e registro é usado quando do seu descarte após encerrado o prazo de validade.