Os medicamentos termolábeis devem ser armazenados em área comum e em temperatura ambiente.

Os medicamentos podem ser acondicionados diretamente sobre o piso ou encostados nas paredes, porém devem ter distância mínima de 1 metro do telhado.

Os imunobiológicos (soros e vacinas) devem ser conservados em um sistema chamado rede de frio, em condições adequadas de refrigeração, desde o laboratório produtor até a destinação final do produto.

Os medicamentos sujeitos a controle especial (Port. nº 344/1998) podem ser armazenados com os demais medicamentos, mas sob responsabilidade legal do farmacêutico.

É recomendável que medicamentos com embalagens semelhantes ou nomes parecidos sejam armazenados na mesma prateleira, porém com uma distância de 20 cm entre eles.