A Hidrovia Tocantins–Araguaia tem como um dos seus objetivos:

a) restaurar ambientalmente a dinâmica hidrológica da bacia Tocantins–Araguaia, com obras de contenção de erosões e recuperação das matas de galeria.
b) ampliar a produção agropecuária no entorno de 10 km ao longo de toda a hidrovia, com base em técnicas sustentáveis.
c) consolidar um eixo de transporte hidro–rodo–ferroviá– rio que ligue as regiões de Mato Grosso aos portos do Maranhão e Pará, através do Tocantins.
d) favorecer mudanças no modo de vida e perda do bem–estar das populações indígenas e ribeirinhas.