A auditoria de programa, entre outros aspectos, visa a:

a) apurar em que medida as ações implementadas lograram produzir os efeitos pretendidos pela administração.
b) examinar as peças que instruem os processos de tomada ou prestação de contas, com vistas a avaliar a gestão dos gestores públicos.
c) identificar as áreas críticas e riscos potenciais, proporcionado as bases para sua eliminação ou redução.
d) assegurar a adequação, privacidade dos dados e informações oriundas dos sistemas eletrônicos de processamento de dados, observando as diretrizes estabelecidas e a legislação específica.
e) verificar se os registros contábeis foram efetuados de acordo com os princípios fundamentais de contabilidade e se as demonstrações deles originárias refletem, adequadamente, em seus aspectos mais relevantes, a situação econômico-financeira do patrimônio, os resultados do período administrativo examinado e as demais situações nelas demonstradas.