Prova de Genética – Concurso INPI para Pesquisador Industrial

Com relação à análise de sequenciamento de genomas e ao GRC (Genome Reference Consortium), que é responsável por manter e melhorar a montagem do genoma de referência humano e do de outras espécies, julgue os itens seguintes. O genoma é definido como uma completa amostragem dos genes expressos sob uma condição particular.

Frederick Sanger, um dos cientistas mais importantes do século XX, foi agraciado com o prêmio Nobel de Química devido a sua contribuição para o desenvolvimento de um método de sequenciamento de DNA, batizado com seu nome, que possibilitou a revolução genômica da Biologia na última década daquele século.

Tendo o fragmento de texto acima como referência inicial, julgue os seguintes itens, acerca das ciências genômicas.

Uma consequência da utilização dos microarranjos de DNA, a primeira forma experimental de medir níveis de expressão gênica de milhares de genes em paralelo, foi a disseminação, na bioinformática, da linguagem de programação R, que facilita a complexa análise dos dados gerados por essa metodologia.

Acerca do sequenciamento de genomas, julgue os itens seguintes. Faz parte da proteômica, subárea da genômica, a identificação do grupo de proteínas de uma célula ou organismo sob um conjunto de condições. Essa subárea, porém, não envolve os estudos de modificações pós-traducionais daquelas proteínas.

Acerca da anotação de sequências genômicas em bancos de dados, julgue os itens que se seguem. O banco de dados do GenBank, denominado OMIM, armazena os nucleotídeos (DNA e RNA) que estejam patenteados.

O prêmio Nobel de Química de 2013 foi concedido a cientistas pioneiros da bioinformática estrutural, que desenvolveram modelos computacionais para a simulação de dinâmica de proteínas. Acerca da bioinformática estrutural, julgue os itens que se seguem. Na dinâmica molecular, aproximações baseadas em modelos da física clássica são utilizadas para simular o movimento coordenado dos átomos e, com isso, capturar as flutuações conformacionais de moléculas, incluindo proteínas e ácidos nucleicos.

Frederick Sanger, um dos cientistas mais importantes do século XX, foi agraciado com o prêmio Nobel de Química devido a sua contribuição para o desenvolvimento de um método de sequenciamento de DNA, batizado com seu nome, que possibilitou a revolução genômica da Biologia na última década daquele século.

Tendo o fragmento de texto acima como referência inicial, julgue os seguintes itens, acerca das ciências genômicas.

As mobilizações de elementos transponíveis, que constituem aproximadamente metade do genoma humano, ocorrem tanto em células somáticas quanto em células germinativas, mas somente estas últimas podem ser herdadas, podendo ou não ter efeito fenotípico.

O prêmio Nobel de Química de 2013 foi concedido a cientistas pioneiros da bioinformática estrutural, que desenvolveram modelos computacionais para a simulação de dinâmica de proteínas. Acerca da bioinformática estrutural, julgue os itens que se seguem. Bancos de dados como Pfam, SMART e CDD são importantes para auxiliar na anotação funcional de proteínas, uma vez que catalogam milhares de domínios proteicos, os quais são segmentos discretos e conservados que adotam uma estrutura tridimensional particular no contexto da proteína.

Frederick Sanger, um dos cientistas mais importantes do século XX, foi agraciado com o prêmio Nobel de Química devido a sua contribuição para o desenvolvimento de um método de sequenciamento de DNA, batizado com seu nome, que possibilitou a revolução genômica da Biologia na última década daquele século.

Tendo o fragmento de texto acima como referência inicial, julgue os seguintes itens, acerca das ciências genômicas.

Atualmente, as sequências das regiões centroméricas e teloméricas dos cromossomos humanos não são completamente conhecidas, uma vez que a alta incidência de regiões repetitivas, que caracteriza o genoma humano, dificulta a montagem nesses segmentos.

A partir da metade da primeira década do século XXI, com o advento de novas tecnologias de sequenciamento de DNA (tecnologias NGS), ocorreu uma revolução nas ciências genômicas. A capacidade de geração de sequências foi incrementada, com a consequente queda nos custos. No que se refere a essas tecnologias, julgue os itens de 77 a 82. O mapeamento genômico de sequências curtas oriundas de tecnologias NGS contra um genoma de referência utiliza algoritmos derivados do programa Blast, que faz uma busca eficiente por similaridade entre um grande número de sequências.

Com o advento do sequenciamento de ácidos nucleicos em larga escala, tornou-se possível realizar a comparação de organismos em termos de suas sequências de DNA e das proteínas codificadas por essas sequências. No que diz respeito ao alinhamento de sequências, julgue os itens a seguir. Um alinhamento múltiplo auxilia no estabelecimento de uma relação evolutiva entre organismos e permite identificar sequências conservadas.

Frederick Sanger, um dos cientistas mais importantes do século XX, foi agraciado com o prêmio Nobel de Química devido a sua contribuição para o desenvolvimento de um método de sequenciamento de DNA, batizado com seu nome, que possibilitou a revolução genômica da Biologia na última década daquele século.

Tendo o fragmento de texto acima como referência inicial, julgue os seguintes itens, acerca das ciências genômicas.

A bioinformática foi determinante para o sucesso da genômica: as ferramentas computacionais possibilitaram montar as sequências dos genomas. Atualmente, algoritmos avançados permitem prever a localização exata dos genes, bem como estabelecer sua função celular.

A partir da metade da primeira década do século XXI, com o advento de novas tecnologias de sequenciamento de DNA (tecnologias NGS), ocorreu uma revolução nas ciências genômicas. A capacidade de geração de sequências foi incrementada, com a consequente queda nos custos. No que se refere a essas tecnologias, julgue os itens de 77 a 82. Embora tenha custo elevado, o sequenciamento de um genoma pelo método Sanger gera uma montagem do genoma com maior tamanho médio de regiões contíguas de sequência (contigs) comparado com tecnologias NGS, dada a mesma cobertura média de bases.

Frederick Sanger, um dos cientistas mais importantes do século XX, foi agraciado com o prêmio Nobel de Química devido a sua contribuição para o desenvolvimento de um método de sequenciamento de DNA, batizado com seu nome, que possibilitou a revolução genômica da Biologia na última década daquele século.

Tendo o fragmento de texto acima como referência inicial, julgue os seguintes itens, acerca das ciências genômicas.

A tecnologia Sanger para o sequenciamento de DNA baseia-se essencialmente nas distinções químicas entre as bases nitrogenadas de um nucleotídeo para decifrar a sequência do DNA.

Com relação à análise de sequenciamento de genomas e ao GRC (Genome Reference Consortium), que é responsável por manter e melhorar a montagem do genoma de referência humano e do de outras espécies, julgue os itens seguintes. Para acessar e utilizar os dados da nova montagem (assembly) do genoma humano (GRCh38), que foi liberado recentemente, o interessado deve pagar uma licença ao GRC.

Na década de 70 do século passado, o cientista Carl Woese revolucionou o meio científico ao utilizar a sequência do RNA ribossômico (rRNA) para classificar os organismos. Com esse uso pioneiro da filogenia molecular, surgiu a classificação dos organismos em três domínios: eucariotos, bactérias e arquea. Considerando esse assunto, julgue os próximos itens, referentes ao papel da bioinformática no estudo da evolução de genes e de organismos. A construção de árvores filogenéticas, que se baseia em sequências moleculares de proteínas ou de nucleotídeos, utiliza metodologias como máxima verossimilhança, máxima parcimônia e inferência bayesiana para fornecer representações exatas da taxonomia de um grupo de organismos.

Acerca da anotação de sequências genômicas em bancos de dados, julgue os itens que se seguem. O banco de dados GEO (gene expression omnibus) é o repositório público de dados de genômica relacionados ao sequenciamento de alto desempenho, genotipagem e arranjos de genes com expressão validada por curadoria.

Na década de 70 do século passado, o cientista Carl Woese revolucionou o meio científico ao utilizar a sequência do RNA ribossômico (rRNA) para classificar os organismos. Com esse uso pioneiro da filogenia molecular, surgiu a classificação dos organismos em três domínios: eucariotos, bactérias e arquea. Considerando esse assunto, julgue os próximos itens, referentes ao papel da bioinformática no estudo da evolução de genes e de organismos. A metagenômica estuda as comunidades microbianas nos seus ambientes naturais. Técnicas de NGS são utilizadas para sequenciar regiões do gene de rRNA 16S. Computacionalmente, mesmo sequências que apresentem diferenças de até 3% das bases podem ser consideradas provenientes da mesma espécie.

Acerca do sequenciamento de genomas, julgue os itens seguintes. A transcritômica visa sequenciar e analisar as sequências nucleotídicas a fim de identificar genes e outras sequências importantes, como as regiões reguladoras de genes.

Com o advento do sequenciamento de ácidos nucleicos em larga escala, tornou-se possível realizar a comparação de organismos em termos de suas sequências de DNA e das proteínas codificadas por essas sequências. No que diz respeito ao alinhamento de sequências, julgue os itens a seguir. Os alinhamentos de genomas completos podem revelar deleções completas de blocos gênicos ou duplicações gênicas, as quais são importantes mecanismos de evolução.

Tendo em vista que a bioinformática possui estreita relação com o sistema operacional Linux, softwares livres e dependência de hardwares específicos para viabilizar as análises, julgue os itens de 91 a 95, relativos ao desenvolvimento de software na bioinformática. O Linux, sistema operacional da família Unix, é amplamente utilizado na bioinformática por ser livre e possuir uma distribuição oficial centralizada.