A abertura de créditos especiais depende da existência de recursos provenientes de excesso de arrecadação, enquanto suplementares podem usar superávit financeiro.

Créditos especiais criam dotações orçamentárias, enquanto créditos suplementares apenas reforçam as existentes.

Não há diferença fundamental quanto às fontes de recursos, pois ambos podem ser abertos utilizando as fontes previstas no Art. 43 da Lei nº 4.320/64.

Créditos suplementares só podem ser abertos por decreto, enquanto créditos especiais exigem lei específica.

Créditos suplementares criam dotações orçamentárias, enquanto créditos especiais apenas reforçam as existentes.