Foi iniciada com as expedições portuguesas e espanholas cruzando a região em busca de metais, escravos, e de uma rota para o Paraguai e Peru. Acentuou-se nos anos seiscentos, do século XVII, com a implantação das Reduções Jesuíticas no Guairá e com as bandeiras paulistas que invadiram a região, capturando índios.

A Guerra de conquista nos territórios na Bacia do Tibagi prosseguiu no século XVIII com a descoberta de ouro e diamantes no Tibagi e com as expedições militares que construíram fortificações e cruzaram o território rumo ao Mato Grosso.

As bandeiras paulistas agiam sem a necessária construção militar no vale do Tibagi. Em 1628, Antônio Raposo Tavares e Manoel Preto, ao atacarem o Guairá, por todo seu efetivo armado e treinado, não careceram de um forte ou campo entrincheirado.

Destruídas as Reduções Jesuíticas, as populações indígenas se dispersam, parte foi para o sul junto com os padres fundar os sete povos das missões, outra parte voltou a reocupar seus antigos territórios.

No século XX, a guerra de conquista continuou com o saque e invasão sistemática - com apoio institucional ou por ações isoladas de fazendeiros e agricultores da região - das terras da Reserva Indígena dos Kaingang em São Jerônimo da Serra, a última tentativa ocorreu em janeiro de 1996.