O algoritmo diagnóstico atual do Ministério da Saúde do Brasil recomenda a realização de um teste sorológico inicial (quimioluminescência) e, se reagente, confirmação com um teste de diferente princípio metodológico (ex: imunoblot), seguido de carga viral se houver discordância.

O teste de imunoblot (Western blot) perdeu sua utilidade no diagnóstico do HIV devido à baixa especificidade, sendo substituído exclusivamente por testes moleculares (PCR) em todos os casos.

O ensaio de quimioluminescência (CLIA) para antígeno p24 é o método mais sensível para detectar a infecção aguda pelo HIV, mesmo antes da soroconversão, sendo superior à PCR quantitativa (carga viral).

O teste rápido para HIV, baseado na detecção de anticorpos anti-HIV-1/2, é suficiente para o diagnóstico definitivo, pois apresenta sensibilidade de 100% durante a janela imunológica.

A PCR quantitativa (carga viral) é o método de escolha para o diagnóstico inicial do HIV em recém-nascidos de mães soropositivas, pois os anticorpos maternos (IgG) podem persistir no bebê por até 18 meses, interferindo nos testes sorológicos.