O primeiro núcleo populacional teve origem com um grupo de pessoas provenientes de Santa Cruz do Sul, refugiados da Revolução Federalista (1893-1895), que se estabeleceu nessa área.

Durante a busca por sua sobrevivência através da caça e da pesca, ocorreu a descoberta de um rio afluente do Uruguai, com um banhado borbulhante, que devido aos significativos benefícios sobre a saúde, recebeu o nome de Águas Milagrosas do Rio do Mel.

Em 1916, 32 pessoas, entre elas autoridades municipais e estaduais do município de São Pedro das Missões, a que pertencia esta região, acamparam nos arredores da fonte das águas termais e, simbolicamente, fundaram a “Villa das Águas do Mel”.

A denominação Irahy (Águas do Mel) é originária da língua indígena guarani, “ira” (mel) e “hy” (água). Décadas mais tarde, surgiu a grafia “Iraí” devido às modificações na ortografia.

Em 15 de novembro de 1935, ano em que se comemorava o cinquentenário da Proclamação da República, foi inaugurado o moderno e original Balneário Oswaldo Cruz, único do gênero na América do Sul.